Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndrg3Q9QYF9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms