Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rdh11Q9QYF1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rdh11Q9QYF1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rdh11Q9QYF1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdh11Q9QYF1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdh11Q9QYF1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdh11Q9QYF1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdh11Q9QYF1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdh11Q9QYF1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Rdh11Q9QYF1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdh11Q9QYF1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdh11Q9QYF1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdh11Q9QYF1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdh11Q9QYF1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rdh11Q9QYF1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Rdh11Q9QYF1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rdh11Q9QYF1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rdh11Q9QYF1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rdh11Q9QYF1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Rdh11Q9QYF1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rdh11Q9QYF1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rdh11Q9QYF1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Rdh11Q9QYF1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Rdh11Q9QYF1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rdh11Q9QYF1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Rdh11Q9QYF1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rdh11Q9QYF1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Rdh11Q9QYF1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rdh11Q9QYF1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Rdh11Q9QYF1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Rdh11Q9QYF1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rdh11Q9QYF1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Rdh11Q9QYF1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rdh11Q9QYF1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rdh11Q9QYF1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rdh11Q9QYF1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rdh11Q9QYF1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rdh11Q9QYF1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rdh11Q9QYF1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rdh11Q9QYF1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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