Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY6

Ehd3, EH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ehd3Q9QXY6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ehd3Q9QXY6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ehd3Q9QXY6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms