Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cbx8Q9QXV1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx8Q9QXV1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx8Q9QXV1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms