Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Apbb1Q9QXJ1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apbb1Q9QXJ1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apbb1Q9QXJ1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms