Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm2bQ9JME9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm2bQ9JME9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms