Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM83

Calm4, Calmodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm4Q9JM83 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Calm4Q9JM83 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Calm4Q9JM83 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calm4Q9JM83 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calm4Q9JM83 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calm4Q9JM83 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calm4Q9JM83 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Calm4Q9JM83 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms