Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cul3Q9JLV5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cul3Q9JLV5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms