Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2l2Q9JLG4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2l2Q9JLG4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms