Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlr5Q9JLF7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tlr5Q9JLF7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms