Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irx5Q9JKQ4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irx5Q9JKQ4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx5Q9JKQ4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx5Q9JKQ4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms