Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Chrac1Q9JKP8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Chrac1Q9JKP8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chrac1Q9JKP8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms