Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ndufaf3Q9JKL4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms