Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scamp5Q9JKD3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scamp5Q9JKD3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms