Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pard6bQ9JK83 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pard6bQ9JK83 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pard6bQ9JK83 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms