Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU9

Crybb3, Beta-crystallin B3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crybb3Q9JJU9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Crybb3Q9JJU9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Crybb3Q9JJU9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Crybb3Q9JJU9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Crybb3Q9JJU9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Crybb3Q9JJU9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Crybb3Q9JJU9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crybb3Q9JJU9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Crybb3Q9JJU9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Crybb3Q9JJU9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Crybb3Q9JJU9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Crybb3Q9JJU9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crybb3Q9JJU9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crybb3Q9JJU9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crybb3Q9JJU9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crybb3Q9JJU9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crybb3Q9JJU9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crybb3Q9JJU9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crybb3Q9JJU9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crybb3Q9JJU9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crybb3Q9JJU9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crybb3Q9JJU9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crybb3Q9JJU9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crybb3Q9JJU9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crybb3Q9JJU9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crybb3Q9JJU9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crybb3Q9JJU9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crybb3Q9JJU9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crybb3Q9JJU9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Crybb3Q9JJU9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms