Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI11

Stk4, Serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk4Q9JI11 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk4Q9JI11 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stk4Q9JI11 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms