Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RabggtaQ9JHK4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RabggtaQ9JHK4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms