Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tm9sf3Q9ET30 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Tm9sf3Q9ET30 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tm9sf3Q9ET30 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms