Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Brd4Q9ESU6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Brd4Q9ESU6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Brd4Q9ESU6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Brd4Q9ESU6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Brd4Q9ESU6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Brd4Q9ESU6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Brd4Q9ESU6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Brd4Q9ESU6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Brd4Q9ESU6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Brd4Q9ESU6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Brd4Q9ESU6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Brd4Q9ESU6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Brd4Q9ESU6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Brd4Q9ESU6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Brd4Q9ESU6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Brd4Q9ESU6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Brd4Q9ESU6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Brd4Q9ESU6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Brd4Q9ESU6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Brd4Q9ESU6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Brd4Q9ESU6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Brd4Q9ESU6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Brd4Q9ESU6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Brd4Q9ESU6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Brd4Q9ESU6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Brd4Q9ESU6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms