Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ropn1Q9ESG2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ropn1Q9ESG2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms