Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc4Q9ES56 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc4Q9ES56 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc4Q9ES56 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc4Q9ES56 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc4Q9ES56 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc4Q9ES56 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc4Q9ES56 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc4Q9ES56 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc4Q9ES56 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc4Q9ES56 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc4Q9ES56 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc4Q9ES56 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc4Q9ES56 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc4Q9ES56 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc4Q9ES56 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc4Q9ES56 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc4Q9ES56 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc4Q9ES56 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc4Q9ES56 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc4Q9ES56 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc4Q9ES56 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc4Q9ES56 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc4Q9ES56 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc4Q9ES56 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc4Q9ES56 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc4Q9ES56 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc4Q9ES56 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc4Q9ES56 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc4Q9ES56 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc4Q9ES56 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc4Q9ES56 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc4Q9ES56 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc4Q9ES56 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc4Q9ES56 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc4Q9ES56 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc4Q9ES56 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc4Q9ES56 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc4Q9ES56 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms