Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cse1lQ9ERK4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cse1lQ9ERK4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cse1lQ9ERK4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cse1lQ9ERK4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cse1lQ9ERK4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cse1lQ9ERK4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cse1lQ9ERK4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cse1lQ9ERK4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cse1lQ9ERK4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cse1lQ9ERK4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cse1lQ9ERK4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cse1lQ9ERK4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cse1lQ9ERK4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cse1lQ9ERK4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cse1lQ9ERK4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cse1lQ9ERK4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cse1lQ9ERK4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cse1lQ9ERK4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cse1lQ9ERK4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cse1lQ9ERK4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cse1lQ9ERK4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cse1lQ9ERK4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cse1lQ9ERK4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cse1lQ9ERK4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cse1lQ9ERK4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cse1lQ9ERK4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cse1lQ9ERK4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cse1lQ9ERK4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cse1lQ9ERK4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cse1lQ9ERK4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cse1lQ9ERK4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cse1lQ9ERK4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cse1lQ9ERK4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cse1lQ9ERK4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cse1lQ9ERK4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cse1lQ9ERK4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cse1lQ9ERK4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cse1lQ9ERK4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cse1lQ9ERK4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cse1lQ9ERK4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cse1lQ9ERK4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cse1lQ9ERK4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cse1lQ9ERK4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cse1lQ9ERK4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cse1lQ9ERK4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cse1lQ9ERK4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cse1lQ9ERK4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cse1lQ9ERK4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms