Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

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Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc28a3Q9ERH8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc28a3Q9ERH8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc28a3Q9ERH8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc28a3Q9ERH8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc28a3Q9ERH8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc28a3Q9ERH8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc28a3Q9ERH8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc28a3Q9ERH8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc28a3Q9ERH8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc28a3Q9ERH8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc28a3Q9ERH8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc28a3Q9ERH8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc28a3Q9ERH8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Slc28a3Q9ERH8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc28a3Q9ERH8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc28a3Q9ERH8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc28a3Q9ERH8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc28a3Q9ERH8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc28a3Q9ERH8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc28a3Q9ERH8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc28a3Q9ERH8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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