Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rapgef4Q9EQZ6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rapgef4Q9EQZ6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rapgef4Q9EQZ6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rapgef4Q9EQZ6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rapgef4Q9EQZ6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rapgef4Q9EQZ6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rapgef4Q9EQZ6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rapgef4Q9EQZ6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rapgef4Q9EQZ6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rapgef4Q9EQZ6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rapgef4Q9EQZ6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rapgef4Q9EQZ6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rapgef4Q9EQZ6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rapgef4Q9EQZ6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rapgef4Q9EQZ6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rapgef4Q9EQZ6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rapgef4Q9EQZ6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rapgef4Q9EQZ6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rapgef4Q9EQZ6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rapgef4Q9EQZ6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms