Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndst3Q9EQH7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndst3Q9EQH7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndst3Q9EQH7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Ndst3Q9EQH7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndst3Q9EQH7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Ndst3Q9EQH7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Ndst3Q9EQH7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Ndst3Q9EQH7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ndst3Q9EQH7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ndst3Q9EQH7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ndst3Q9EQH7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Ndst3Q9EQH7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ndst3Q9EQH7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ndst3Q9EQH7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ndst3Q9EQH7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ndst3Q9EQH7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ndst3Q9EQH7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ndst3Q9EQH7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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