Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clstn1Q9EPL2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Clstn1Q9EPL2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms