Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Tspan4Q9DCK3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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