Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syde1Q9DBZ9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syde1Q9DBZ9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms