Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc97Q9DBT3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms