Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med27Q9DB40 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms