Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmtm2aQ9DAR1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm2aQ9DAR1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm2aQ9DAR1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm2aQ9DAR1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm2aQ9DAR1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm2aQ9DAR1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm2aQ9DAR1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm2aQ9DAR1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm2aQ9DAR1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmtm2aQ9DAR1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cmtm2aQ9DAR1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms