Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Rnf138rt1Q9D9M9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Rnf138rt1Q9D9M9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Rnf138rt1Q9D9M9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Rnf138rt1Q9D9M9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf138rt1Q9D9M9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Rnf138rt1Q9D9M9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf138rt1Q9D9M9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Rnf138rt1Q9D9M9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Rnf138rt1Q9D9M9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf138rt1Q9D9M9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.29■■□□□ 1
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Rnf138rt1Q9D9M9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf138rt1Q9D9M9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf138rt1Q9D9M9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf138rt1Q9D9M9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
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