Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx5Q9D8U8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx5Q9D8U8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx5Q9D8U8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms