Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c6Q9D8P7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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