Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc91Q9D8L5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc91Q9D8L5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms