Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Derl3Q9D8K3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms