Protein–RNA interactions for Protein: Q9D842

Aplf, Aprataxin and PNK-like factor, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AplfQ9D842 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AplfQ9D842 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AplfQ9D842 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
AplfQ9D842 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
AplfQ9D842 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AplfQ9D842 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AplfQ9D842 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AplfQ9D842 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AplfQ9D842 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AplfQ9D842 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AplfQ9D842 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AplfQ9D842 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AplfQ9D842 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AplfQ9D842 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AplfQ9D842 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AplfQ9D842 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AplfQ9D842 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AplfQ9D842 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AplfQ9D842 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AplfQ9D842 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AplfQ9D842 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AplfQ9D842 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AplfQ9D842 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms