Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn9Q9D805 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms