Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7M8

Polr2d, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2dQ9D7M8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2dQ9D7M8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2dQ9D7M8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2dQ9D7M8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2dQ9D7M8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2dQ9D7M8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2dQ9D7M8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2dQ9D7M8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2dQ9D7M8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2dQ9D7M8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2dQ9D7M8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2dQ9D7M8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2dQ9D7M8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2dQ9D7M8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2dQ9D7M8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2dQ9D7M8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2dQ9D7M8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2dQ9D7M8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2dQ9D7M8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2dQ9D7M8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2dQ9D7M8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2dQ9D7M8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2dQ9D7M8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2dQ9D7M8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2dQ9D7M8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2dQ9D7M8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2dQ9D7M8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms