Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnfsf13Q9D777 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnfsf13Q9D777 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnfsf13Q9D777 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnfsf13Q9D777 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnfsf13Q9D777 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnfsf13Q9D777 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnfsf13Q9D777 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnfsf13Q9D777 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnfsf13Q9D777 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnfsf13Q9D777 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnfsf13Q9D777 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnfsf13Q9D777 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnfsf13Q9D777 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnfsf13Q9D777 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnfsf13Q9D777 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnfsf13Q9D777 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfsf13Q9D777 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tnfsf13Q9D777 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tnfsf13Q9D777 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf13Q9D777 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf13Q9D777 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf13Q9D777 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf13Q9D777 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf13Q9D777 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf13Q9D777 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf13Q9D777 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf13Q9D777 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf13Q9D777 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf13Q9D777 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf13Q9D777 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf13Q9D777 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf13Q9D777 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf13Q9D777 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf13Q9D777 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf13Q9D777 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf13Q9D777 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf13Q9D777 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf13Q9D777 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf13Q9D777 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf13Q9D777 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms