Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpap3Q9D706 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms