Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tube1Q9D6T1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms