Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lpcat2bQ9D5U0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms