Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clvs1Q9D4C9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clvs1Q9D4C9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Clvs1Q9D4C9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clvs1Q9D4C9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Clvs1Q9D4C9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clvs1Q9D4C9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms