Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9D454 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9D454 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9D454 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9D454 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9D454 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9D454 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9D454 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9D454 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9D454 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9D454 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9D454 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9D454 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9D454 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9D454 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D454 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D454 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D454 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D454 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D454 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D454 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D454 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D454 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D454 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D454 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D454 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D454 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D454 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9D454 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9D454 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9D454 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9D454 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9D454 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9D454 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9D454 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9D454 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9D454 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9D454 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9D454 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9D454 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9D454 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9D454 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9D454 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9D454 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9D454 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9D454 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9D454 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9D454 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9D454 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9D454 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9D454 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9D454 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D454 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D454 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D454 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D454 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D454 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D454 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D454 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D454 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D454 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9D454 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9D454 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9D454 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9D454 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9D454 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9D454 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9D454 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9D454 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9D454 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9D454 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9D454 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9D454 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9D454 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9D454 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D454 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D454 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D454 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D454 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D454 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D454 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q9D454 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q9D454 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q9D454 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q9D454 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D454 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D454 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D454 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D454 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D454 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D454 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D454 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D454 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D454 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D454 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D454 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D454 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D454 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D454 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D454 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms