Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisal2bQ9D1Y9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal2bQ9D1Y9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms