Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Mrpl28Q9D1B9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms