Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arv1Q9D0U9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms