Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab3bQ9CZT8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms